Miokardīta medikamentozās ārstēšanas galvenos virzienus nosaka miokardīta patogenēzes galvenās saites: infekcijas izraisīts iekaisums, nepietiekama imūnreakcija, kardiomiocītu bojāeja (nekrozes un progresējošas distrofijas, miokardītiskas kardiosklerozes dēļ) un kardiomiocītu metabolisma traucējumi. Jāņem vērā, ka bērniem miokardīts bieži rodas uz hroniskas fokālās infekcijas fona, kas kļūst par nelabvēlīgu fonu (organisma intoksikācija un sensibilizācija), veicinot miokardīta attīstību un progresēšanu.