Lai izolētu polimorfās DNS reģionus, tiek izmantoti baktēriju enzīmi - restriktāzes, kuru produkts ir restrikcijas vietas. Spontānas mutācijas, kas rodas polimorfās vietās, padara tās rezistentas vai, gluži pretēji, jutīgas pret specifiskas restriktāzes darbību.