Katru primāro lipoproteīnu raksturo atsevišķa, tikai raksturīga olbaltumviela (apolipoproteīns) tā sastāvā. Apolipoproteīni ir apzīmēti ar latīņu burtiem, no kuriem daži ir olbaltumvielu saime, un tos arī norāda ar skaitļiem (piemēram, apo-A1, apo-A2 utt.).