EEG analīze tiek veikta reģistrēšanas laikā un beidzot pēc tā pabeigšanas. Ierakstīšanas laikā izvērtē klātbūtni artefaktu (cenšoties līnija pašreizējās jomās, mehāniski artefaktus elektrodu kustības, electromyogram, elektrokardiogramma, uc) Veikt pasākumus, lai tos novērstu. Novērtē EEG frekvenci un amplitūdu, identificē raksturīgos grafu elementus, nosaka to telpisko un laika sadalījumu.