Primārajā tuberkulozē bojājumi parasti tiek lokalizēti limfmezglos, plaušās, pleirā un dažreiz citos orgānos: nierēs, locītavās, kaulos, vēderplēvē. Konkrēta iekaisuma zona var būt ļoti maza un pārbaudes laikā ir slēpta. Ar lielu kaitējuma daudzumu to parasti konstatē pacienta klīniskās un radioloģiskās izmeklēšanas laikā.