Pētījums: gēni ietekmē augļu un šķiedrvielu pretvēža efektivitāti

Nesen veiktais pētījums, kas publicēts žurnālā eBioMedicine, atklāja ģenētiskas variācijas, kas var mainīt saistību starp šķiedrvielu, augļu un dārzeņu uzņemšanu un kolorektālā vēža risku ( CRC). Zinātnieki ir veiksmīgi identificējuši divus nozīmīgus lokusus, kas mazina saistību starp šķiedrvielu un augļu uzņemšanu un CRC risku.

CRC ir viens no visizplatītākajiem vēža gadījumiem pasaulē ar gandrīz diviem miljoniem jaunu gadījumu un vairāk nekā 900 000 nāves gadījumu 2020. gadā. Ir ziņots, ka liela augļu, dārzeņu, pilngraudu un uztura šķiedrvielu uzņemšana samazina saslimšanas risku. CRC. Lai gan pastāv pārliecinoši pierādījumi par saistību starp CRC risku un pilngraudu un uztura šķiedrvielu patēriņu, pierādījumi par saistību starp CRC risku un augļu un dārzeņu uzņemšanu joprojām ir ierobežoti.

Iepriekšējie genoma mēroga asociācijas pētījumi (GWAS) ir spējuši identificēt vismaz 200 lokusus, kas saistīti ar CRC risku, izskaidrojot līdz pat 35% pārmantojamības. Lai gan gēnu un vides (G × E) mijiedarbība var izskaidrot papildu pārmantojamību, iepriekšējie pētījumi ar maziem paraugiem un tradicionālajām metodēm ir atklājuši tikai ierobežotu skaitu nozīmīgu mijiedarbību. Jaunas statistikas pieejas, piemēram, apvienotie testi un divpakāpju metodes, kas piešķir prioritāti viena nukleotīda polimorfismiem (SNP), potenciāli var uzlabot šo analīžu precizitāti.

Analīzē tika iekļauti līdz pat 45 pētījumiem no trim CRC ģenētiskajiem konsorcijiem, tostarp Eiropas izcelsmes indivīdiem. Pētījumi ietvēra gadījumu kontroles kohortas pētījumiem un bezvēža kontroles gadījumu kontroles pētījumiem. Kopumā tika analizēti attiecīgi 69 599, 69 734 un 44 890 dalībnieki attiecībā uz augļu, dārzeņu un šķiedrvielu uzņemšanu. Uztura daudzums tika novērtēts, izmantojot ēšanas biežuma anketas un uztura vēsturi, ko parasti izsaka kā porcijas dienā augļiem un dārzeņiem un gramus dienā attiecībā uz kopējo šķiedrvielu daudzumu.

Dati tika saskaņoti un izteikti kā kvartiles pēc dzimuma un pētījuma. Turklāt genotipēšanas kvalitātes kontrole ietvēra trūkstošo datu, Hārdija-Veinberga līdzsvara un dzimuma neatbilstības pārbaudi, kam sekoja imputācija un filtrēšana, lai iegūtu nelielu alēļu biežumu un precizitāti, kā rezultātā tika analizēti 7 250 911 SNP.

Salīdzinot ar kontroles grupu, dalībnieki ar CRC bija vecāki, viņiem bija augstāks ķermeņa masas indekss un lielāks enerģijas patēriņš, kā arī lielāka riska faktoru, piemēram, CRC un 2. Tipa cukura diabēta ģimenes anamnēze, izplatība. Viņi arī patērēja mazāk šķiedrvielu, augļu un dārzeņu, salīdzinot ar kontroles grupu. Metaanalīzes atklāja apgrieztu saistību starp šķiedrvielu uzņemšanu (relatīvais risks uz kvartiles pieaugumu (OR) = 0,79), augļu (OR = 0,79) un dārzeņu (OR = 0,82) un CRC risku.

3-DF tests identificēja rs4730274 lokusu augšpus SLC26A3 gēna, kas liecina par saistību ar šķiedrvielu uzņemšanu un mijiedarbību ar CRC risku. Stratifikācija pēc genotipa uzrādīja spēcīgāku apgriezto saistību starp šķiedru un CRC katrai T alēles kopijai. Funkcionālā anotācija liecināja par pastiprinātāja aktivitāti resnās zarnas audos ar eQTL DLD gēnam.

Rs1620977 lokuss netālu no NEGR1 gēna uzrādīja būtisku saistību ar augļu patēriņu un mērenu mijiedarbību ar CRC risku. Tika novērotas spēcīgas apgrieztas asociācijas, palielinoties augļu patēriņam katrai G alēles kopijai.

Pētījums ir līdz šim lielākais G × E pētījums, kurā pētnieki atklāja divas mijiedarbības starp šķiedrvielu un augļu uzņemšanu un CRC risku. Jo īpaši rs4730274 netālu no SLC26A3 gēna liecina par būtisku saistību starp šķiedrvielu uzņemšanu, zarnu darbību, iekaisumu un CRC. Rezultātiem ir nepieciešama turpmāka izpēte, lai pārbaudītu klīniskās sekas un apstiprinātu šos atklājumus dažādās populācijās.